同時，云計算的優勢也成為安全的挑戰。云計算的易用性讓數據安全面臨挑戰，服務與數據的外包帶來數據的機密性、完整性與可用性風險；云計算的開放性帶來了平臺與服務安全的挑戰，開放平臺結構與用戶行為代碼運行為云計算帶來安全威脅；云計算的高擴展性帶來的是安全管理的挑戰，大量異構軟硬件設備集中管控帶來安全風險。
多位專家指出，針對云計算面臨的各種安全挑戰，應從多角度出發，全面推動云計算安全關鍵技術研究，優化發展環境，以適應云計算發展與應用的需要。
      從技術層面來看，需要充分利用技術手段構建云安全服務體系。云計算提供的超大規模計算能力與海量存儲能力在事件采集、關聯分析、病毒防范等方面的性能可大幅提升，可以構建超大規模安全事件信息處理平臺，提升網絡安全態勢把握能力。同時，云計算環境中存在大量異構終端與資源，需要高彈性、可擴展的共性安全服務，為用戶提供身份認證與鑒別、訪問控制、隱私保護、審計與責任認定等技術支持。這些支持主要包括面向云計算的用戶身份認證，服務授權與分級管理等動態控制訪問，基于安全隔離的隱私安全保護，云用戶行為審計與監測等。
從優化發展環境的角度來看，誠信體系的建設是關鍵。要加強云服務安全技術的攻關和研發，提升云計算安全風險分析能力，增強安全技術支撐和服務能力；要制定和完善云服務安全的制度與法律，制定跨境數據流動等方面的制度措施，明確信息所有者和服務者的權益與責任，依法保護知識產權；要完善個人信息保護機制，依法維護個人信息的隱私權益；要建立和完善云計算安全防護和評價體系，讓所有使用云服務者放心，讓信息所有者對存放在云端的信息放心；在推廣應用實踐中，要逐步完善云間交付的接口標準，完善和健全云服務行業的管理制度。