財政部、國家稅務總局《關于調整農業產品增值稅稅率和若干項目征免增值稅的通知》（財稅字【1994】004號）規定，對于屬于增值稅一般納稅人的縣以下（含縣）小型水力發電單位，可以自行選擇17％的稅率或6％的征收率繳納增值稅。

優惠政策出臺之初，小水電企業幾乎都毫不猶豫地選擇了6％的征收率。因為小水電幾乎不耗用原材料，進項稅額抵扣部分很少，而且小水電發電主要是銷給農戶和村鎮小企業，上網售電很少，只要電價便宜，用戶也不索取17％的增值稅專用發票。但是，2001年農村電網改造結束后，小水電站不能對農戶和其他用電企業直接供電，必須將電售給大電網，再由電力部門統一將電賣給用戶。電網公司在收購小水電的電量時，要索取17％的增值稅專用發票，作為它們的進項抵扣。結果小水電企業為了將電賣出去，紛紛轉向選擇17％的稅率。這時繼續選擇6％的征收率比選擇17％的稅率更吃虧。因為，選擇17％的稅率，每年還有一部分進項稅額可以抵扣；如果選擇6％的稅率，買電的電網公司在下一個銷售環節時，也將只能抵扣6％，卻要繳納17％，電網公司顯然不愿多承擔11％的銷項增值稅，所以必然要向小水電企業壓價11％，那樣小水電企業的實際負擔仍達到17％，還不能抵扣進項稅額，更不劃算。

在現實情況下，可以自主選擇增值稅稅率的小水電企業，卻步調一致地選擇了就高不就低，這顯然是違背常理的。稅收優惠在現實中縮水，成為了看上去很美的政策擺設，顯然，有關部門應該反思，相關稅收優惠政策是否在某些環節需要進一步完善了？